BI296Linux操作系统与shell开发的理论与实践课程教学大纲

《Linux操作系统与shell开发的理论与实践》课程教学大纲课程基本信息(Course Information)课程代码*学时*学分BI296322(Course Code)(Credit Hours)(Credits)*课程名称Linux操作系统与shell开发的理论与实践Course TitleLinux Programming for Bioinformatics*课程性质专业基础课(Course Type)Compulsory授课对象生物信息学专业的本科学生(Target Audience)Undergraduates majored in bioinformatics*授课语言中英双语(Language of Instruction)Chinese +English*开课院系生命科学技术学院(School)School of Life Sciences and Biotechnology先修课程无PrerequisiteNonehttp://cbb.sjtu.edu.cn/course/授课教师吴茂英课程网址bi296InstructorMaoying Wu(Course Webpage)https://github.com/ricket-sjtubi296Liux操作系统的编程开发课程，是生物信息学专业与生物数据相关本科专业的专业基础课程。本课程在系统介绍Liuⅸ操作系统的发展历史和计算机基础软硬件基础知识的基础上，要求学生熟练掌握常用的Liux命令，进行操作系统的管理与配置，熟悉基本的Bsh脚本编程思想，并将正则表达式应用于文本数据分析和管理。此外，课程还将着重介绍C程序与库的编译与开发，同时拓展学生对*课程简介(Description)类C程序开发的认知。最后，课程将介绍Pyho如脚本编程的基本知识，并与计算机与生物信息学的一些基本数据结构和算法，以及目前蓬勃发展的数据科学结合起来，让学生对学科发展的前沿有更加深刻、直观的认识。作为一门专业基础课，本课程要求学生在掌握基本编程技能的同时，能将学到的知识应用于本学科的数据分析中，因此在课程中结合大量的生物信息学领域的应用，而非单纯的计算机编程课程。