关于植物DNA条形码研究技术规范

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植物分类与资源学报2012,34(6):592~606Plant Diversity and ResourcesD0I:10.3724/SP.J.1143.2012.12138关于植物DNA条形码研究技术规范高连明,刘杰,蔡杰2,杨俊波2,张挺,李德铁2“(1中回科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室,云南昆明650201:2中回科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库,云南昆明650201)摘要:DNA条形码是利用标准的基因片段对物种进行快速鉴定的技术,已经成功用于生物物种分类和鉴定、生态学调查和生物多样性评估等研究领域。尽管生命条形码数据(BOD)系统提供了主要针对动物类群DNA条形码研究的技术规范,但由于植物本身的生物学特性与所使用的条形码不同,因此已有技术规范并不完全适用于植物DNA条形码的研究。本文根据植物DNA条形码研究的特点与我国的实际情况,编写了植物DNA条形码研究技术标准和规范指南,具体包括十个方面的内容,即植物DNA条形码研究的样品采集策略:植物标本和野外数据的采集规范:植物标本图像信息的采集规范:植物DNA材料的采集规范:植物DNA材料的干燥与保存规范:植物总DNA的质量标准及保存规范:植物标准DNA条形码的选择与通用引物:DNA条形码的扩增与测序:DNA条形码数据的命名、编辑和提交规范:以及DNA条形码数据分析。我们期望通过这些标准规范的实施和在实践中的不断修订和完善,能为我国学者开展植物DNA条形码和Flora研究提供参考和借鉴。关键词:植物DNA条形码:技术规范:物种鉴定:标准:新一代植物志中图分类号:Q94-33,Q948.2文献标识码:A文章编号:2095-0845(2012)06-592-15A Synopsis of Technical Notes on the Standardsfor Plant DNA BarcodingGAO Lian-Ming',LIU Jie',CAI Jie2,YANG Jun-Bo2,ZHANG Ting2,LI De-Zhu'"(I Key Laboratory of Bioditersity and Biogeography,Kunming Institute of Botany,Chinese Acadeny of Sciences,Kunming 650201,China;2 Gemplasm Bank of Wild Species,Kunming Institute of Botany,Chinese Acrdemy of Scences,Kunming 650201,China)Abstract:DNA barcoding is a technique using one or a few standardized DNA regions from different genomes forrapid species identification,which is used in the field of taxonomy,ecological surveys and assesment of biodiversi-ty.Because of the plant natural particularity and the DNA barcodes used for plants differing from animals,the stand-ards provided by BOLD which was initially dssigned for animals are not totally compatible in plants DNA barcoding re-search.Thus,we synthesize and customize a synopsis of technical notes and standards with reference of the BOLD cri-teria and experience of plant DNA barcoding projects,especial for the researchers with particular interest in plantsDNA barcoding in China.Ten aspects related to plants DNA barcoding are covered:I sampling strategy for a plantDNA barcoding study,2 collecting standards for vouches and associate information,3)collection standards for speci-men-referenced images,4)collecting standards for DNA material,5)standards for drying and preserving DNA mate-rial,6)quality control and preservation procedures for extracted total genomic DNA,7)recommended plant barcodes*基金项目:中回科学院大科学装置开放研究项目(2009-LSFGB0S-01):云南省中青年学术技术带头人后备人才项目(28P門064):回家科技部科技基偏工作专项项目:回家高科技研究发展计划(863计划)(2012AA021801)*幸通讯f作者:Author for correspondence:E-mail:b以l@mal.kib.aem收稿日期:2012-11-05,2012-11-09接受发表作者简介:高连明(1972-)男,博士、刷研究员,主要从事植物系统发育、群体遗传和DNA条形码等研究。E-mail:gaolm@mail.kib.ac.en
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